هر یک از شوراهای تخصصی دارای کمیته های وابسته بخود هستند که از نظر سلسله مراتب سازمانی در مرحله بعد از این شوراها قرار می گیرند. این کمیته ها که متشکل از تمامی اعضای سازمان جهانی تجارت هستند به شوراهای مربوطه گزارش می دهند .

تعداد این نوع کمیته ها در زیر مجموعه شورای تجارت کالاها 16 مورد است که در زمینه های تخصصی فعالیت می کنند. شورای تجارت خدمات نیز 4 کمیته وابسته به خود دارد. همچنین کمیتهٔ های تخصصی دیگری در سازمان تجارت جهانی وجود دارند که مستقیماً زیر نظر شورای عمومی فعالیت می کنند :

· کمیته تجارت و توسعه

· کمیته محدودیت‌های تراز پرداخت‌ها

· کمیته بودجه، مالی و تشکیلاتی

· کمیته‌ تجارت و محیط زیست

· کمیته موافقت نامه‌های منطقه‌ای تجاری